Nachdem er mehrere Preise bei Jugend musiziert gewonnen hatte, entschied er sich für ein Studium an der Robert Schumann Hochschule in Düsseldorf bei Taskin Oray, welches er mit dem Konzertexamen abschloss. Meisterkurse bei Professor Winfried Liebermann und jahrelanger intensiver Austausch mit ihm haben Ralf-Jörn Köster nachhaltig geprägt. Noch während seines Studiums wurde er 1989 stellvertretender Solo-Oboist bei den Remscheider Symphonikern – heute Bergische Philharmonie.
Als Solo-Oboist wechselte er 1994 an das Mainfranken Theater Würzburg. An gleicher Position spielt er seit 2008 bei der Staatsphilharmonie Nürnberg und ist am Staatstheater Nürnberg zu erleben. Im Laufe seiner Karriere gastierte Ralf-Jörn Köster an nahezu allen Opernhäusern in Deutschland. Er wirkte an zahlreichen CD-Aufnahmen mit renommierten Orchestern mit, so auch 2009 an der Opernproduktion „Merlin“ von Carl Goldmark mit dem Orchester Philharmonie Festiva unter der Leitung von Gerd Schaller, die 2010 mit einem Echo Klassik ausgezeichnet wurde.
Im Jahr 2003 wurde er an die Hochschule für Musik in Würzburg verpflichtet, wo er sein Wissen und seine Leidenschaft für die Oboe an die nächste Generation weitergab. Zwischen 2014 und 2016 übernahm er zunächst eine Professurvertretung an der Hochschule für Musik Nürnberg und leitet seitdem dort seine eigene Oboenklasse. Mit großer Leidenschaft vermittelt der Familienvater von vier Kindern seine reichhaltigen musikalischen und instrumentalen Erfahrungen an junge Oboist:innen.
Im Jahr 2016 veröffentlichte Ralf-Jörn Köster sein erstes Buch mit dem Titel „Von der Holzstange zum Oboenrohr“. Seit 2017 liegt dieses Buch auch in einer englischen Fassung mit dem Titel „Reliable Reeds“ vor. Sein Buch ist mittlerweile zu einem der wichtigsten Standardwerke im Fach Rohrbau avanciert. Ende 2022 konnte Ralf-Jörn Köster bereits die dritte erweiterte deutsche Auflage seines Buches veröffentlichen und so weiteres interessantes Fachwissen zur Verfügung stellen.